Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2l1Q3UNW5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms