Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Tmem253Q3UNB8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Tmem253Q3UNB8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem253Q3UNB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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