Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cog7Q3UM29 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms