Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc34Q3UI66 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms