Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms