Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nom1Q3UFM5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nom1Q3UFM5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nom1Q3UFM5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.2 ms