Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Yipf3Q3UDR8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms