Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbrQ3U9G9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LbrQ3U9G9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms