Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U7U4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U7U4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms