Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp6Q3U6U5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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