Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q3U6N9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q3U6N9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U6N9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U6N9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms