Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otud5Q3U2S4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms