Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KhsrpQ3U0V1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KhsrpQ3U0V1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms