Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d2bQ3U0J8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms