Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmd1Q3TXS7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms