Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eepd1Q3TGW2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eepd1Q3TGW2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eepd1Q3TGW2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Eepd1Q3TGW2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eepd1Q3TGW2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms