Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfp444Q3TDV8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp444Q3TDV8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.9 ms