Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms