Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms