Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Fam171bQ14CH0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms