Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam47cQ14BE7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam47cQ14BE7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms