Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

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Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Atp8b1Q148W0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8b1Q148W0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8b1Q148W0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms