Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal1Q0VBP7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 463 ms