Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAY3

Fam187b, Protein FAM187B, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam187bQ0VAY3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam187bQ0VAY3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam187bQ0VAY3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms