Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf541Q0GGX2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf541Q0GGX2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146 ms