Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc7a1Q09143 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc7a1Q09143 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms