Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cass4Q08EC4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cass4Q08EC4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms