Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tff1Q08423 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff1Q08423 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff1Q08423 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms