Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn3Q07409 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms