Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PSME1Q06323 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms