Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms