Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnd1Q03719 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms