Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GscQ02591 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GscQ02591 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GscQ02591 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GscQ02591 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GscQ02591 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GscQ02591 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GscQ02591 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GscQ02591 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GscQ02591 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GscQ02591 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GscQ02591 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GscQ02591 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GscQ02591 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GscQ02591 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GscQ02591 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GscQ02591 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GscQ02591 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GscQ02591 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GscQ02591 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GscQ02591 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GscQ02591 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GscQ02591 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GscQ02591 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms