Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ank1Q02357 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ank1Q02357 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ank1Q02357 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms