Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snai1Q02085 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snai1Q02085 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snai1Q02085 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms