Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd1Q01822 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd1Q01822 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms