Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp1Q01514 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms