Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrcdQ00LT2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms