Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeleQ00690 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeleQ00690 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeleQ00690 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeleQ00690 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms