Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabpaQ00422 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms