Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb4P99026 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmb4P99026 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms