Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama4P97927 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama4P97927 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama4P97927 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama4P97927 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama4P97927 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama4P97927 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama4P97927 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama4P97927 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama4P97927 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama4P97927 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms