Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vgll3P85442 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms