Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx1P81068 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx1P81068 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Irx1P81068 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms