Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cct3P80318 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cct3P80318 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cct3P80318 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cct3P80318 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms