Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim4P70271 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdlim4P70271 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms