Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms