Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng7P62956 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng7P62956 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng7P62956 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms