Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gnb1P62874 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms