Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps5P59438 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hps5P59438 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps5P59438 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps5P59438 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms